תפקידן המרכזי של מערכות בריאות הוא לדאוג לבריאות טובה של האוכלוסייה ולשמר אותה. חשוב לבחון את מערכת הבריאות בישראל לאורך השנים בהשוואה למערכות בריאות במדינות אחרות, כדי להבין טוב יותר את מצבה הנוכחי ואת אפשרויותיה העתידיות. ניתן לומר שלמרות השחיקה המתמשכת במשאבי המערכת בהשוואה למערכות בריאות שונות בעולם מערכת הבריאות בישראל עומדת באתגר הזה בכבוד. עם זאת עומדים בפניה אתגרים משמעותיים בתחומים כמו אי-שוויון בבריאות, תכנון כוח אדם, יחסי הגומלין בין חלקיה השונים של מערכת הבריאות והרצף הטיפולי בין בתי החולים לקהילה, ועוד. תוכנית המדיניות של מרכז טאוב בתחום הבריאות מתמקדת בכמה היבטים של המערכת, לרבות מגמות בהוצאה הלאומית לבריאות, בחינת רפורמות שונות שבוצעו במערכת, תכנון המערכת לטווח הקצר והארוך, אסטרטגיות להתמודדות עם פערים בבריאות, מדיניות ביטוח בריאות ושאלות של כפל ביטוחי, ותכנון כוח אדם במקצועות הבריאות השונים. התוכנית מתמקדת במגוון תחומי בריאות כמו בריאות הנפש, בריאות תעסוקתית, בריאות השן, בריאות הציבור ורפואה מונעת, אי-שוויון ופערים, מימון ציבורי והקצאת משאבים. כמו כן, תוכנית מדיניות הבריאות פועלת מתוך שיתוף פעולה עם תוכניות אחרות במרכז טאוב מתוך התפיסה הרחבה שכדי לקדם בריאות יש להכיר ולהבין את שלל הגורמים המשפיעים עליה.